Antibiotik yang Digunakan dalam Biologi Molekular

Secara umum, antibiotik itu adalah sebuah senyawa atau zat (juga dikenal dengan chemotherapeutic agent) yang dapat membunuh atau menghambat pertumbuhan bakteri. Antibiotik-antibiotik yang tergolong pada kelompok senyawa-senyawa antimikrobial digunakan untuk mengobati infeksi-infeksi yang disebabkan oleh mikroorganisme termasuk fungi dan protozoa.

Dalam teknik biologi molekular, antibiotik telah digunakan secara luas untuk membunuh/menghambat pertumbuhan bakteri, fungi, yeast dan juga mycoplasma. Berikut ini adalah beberapa jenis antibiotik yang umum digunakan beserta referensi mengenai mekanisme, kisaran penggunaan dan konsentrasi kerja yang diperlukannya.

*Singkatan: Gm(+/-)=Gram positif/negatif; My=mycoplasma; F=fungus; Ye=yeast.

Ampicillin

• Kelas: Beta-lactam
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Menghambat transpeptidase yang diperlukan untuk sintesis dinding sel
• Resistensi disebabkan oleh Beta-lactamase. Memotong cincin beta-lactam pada amphicillin
• Konsentrasi: 100 – 200 ug/ml

Amphotericin B

• Kelas: Beta-lactam
• Kisaran: Ye, Fu, My
• Mekanisme: Membentuk Kompleks dengan kolesterol, membentuk suatu pori yang membuat glukosa bisa lolos (leakage)
• Konsentrasi: 2.5 ug/ml

Carbenicillin

• Kelas: Beta-lactam
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Seperti ampicillin
• Penyebab resistensi sama seperti ampicillin, tetapi carbenicillin rusak lebih lambat oleh beta-lactamase
• Konsentrasi: 100 ug/ml

Chloramphenicol

• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Mengikat pada ribosomal 50S subunit, mencegah peptidyl transferase yang diperlukan untuk translasi
• Resistensi disebabkan oleh Chloramphenicol acetyltransferase yang menambahkan sebuah gugus asetil untuk membentuk AcoA pada chloramphenicol, dengan menginaktifasinya
• Konsentrasi: 5 – 10 ug/ml

Erythromycin

• Kelas: Macrolide
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme mirip dengan chloramphenicol
• Resistensi disebabkan oleh ermC methyltransferase yang memetilasi 23S rRNA, mencegah penempelan erythromycin ke ribosom
• Konsentrasi: 100 ug/ml

Kanamycin

• Kelas: Aminoglycoside
• Kisaran: Gm+, Gm-, My
• Mekanisme: Terikat pada 30S ribosomal sub-unit, memblokir inisiasi kompleks dan menyebabkan frame-shift mutations serta menghambat translasi
• Resistensi disebabkan oleh Kanamycin phosphotransferase yang mempengaruhi posforilasi ATP-dependent pada residu-residu hydroxyl pada kanamycin
• Konsentrasi: 100 ug/ml

Gentamycin

• Kelas: Aminoglycoside
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Mirip dengan kanamycin
• Resistensi disebabkan oleh Gentamycin acetyltransferase; mekanisme mirip dengan chloramphenicol acetyltransferase
• Konsentrasi: 25 – 50 ug/ml

Neomycin

• Kelas: Aminoglycoside
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Mirip dengan kanamycin
• Resistensi disebabkan oleh Neomycin phosphotransferase; mekanisme mirip dengan kanamycin phosphotransferase
• Konsentrasi: 25 – 50 ug/ml

Nystatin

• Kisaran: Ye, Fu
• Mekanisme: Mirip dengan amphotericin B
• Konsentrasi: 50 ug/ml

Rifampicin (Rifampin)

• Kelas: Semi-synthetic
• Kisaran Gm+, Gm-
• Mekanisme: Menghambat DNA dependent RNA polymerase, mencegah terjadinya transkripsi
• Konsentrasi: 50 ug/ml

Streptomycin

• Kelas: Aminoglycoside
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Mengikat pada 16S ribosomal sub-unit, mencegah inisiasi pada translas
• Resistensi disebabkan oleh Streptomycin 3’-adenyltransferase yang mentransfer gugus adenyl dari ATP ke streptomycin
• Konsentrasi: 50 ug/ml

Tetracycline

• Kelas: Tetracyclin
• Kisaran: Gm+, Gm-
• Mekanisme: Mencegah aminoacyl tRNA agar tidak terikat pada 30S sub-unit
• Resistensi disebabkan oleh TetR-TN10 gene yang mengkodekan sebuah inner membrane protein yang memompa tetracycline keluar dari sel
• Konsentrasi: 50 ug/ml

Sumber: bitesizebio.com

Other articles you may like:

• Quorum Sensing: Mencegah Kudeta Bakteri
• Virus Flu H1N1 Pandemik Mulai Resisten Terhadap Tamiflu
• Berbagai Larutan Buffer
• Obat Antiviral untuk Flu Babi (Influenza A H1N1)
• 9 Tips untuk Real-Time PCR
• Quorum Sensing; Hidup Bermasyarakat Ala Bakteri
• Elektroforesis; Pintu Gerbang Penelitian Biologi Molekular