Antibiotik yang Digunakan dalam Biologi Molekular

Staphylococcus aureusSecara umum, antibiotik itu adalah sebuah senyawa atau zat (juga dikenal dengan chemotherapeutic agent) yang dapat membunuh atau menghambat pertumbuhan bakteri. Antibiotik-antibiotik yang tergolong pada kelompok senyawa-senyawa antimikrobial digunakan untuk mengobati infeksi-infeksi yang disebabkan oleh mikroorganisme termasuk fungi dan protozoa.

Dalam teknik biologi molekular, antibiotik telah digunakan secara luas untuk membunuh/menghambat pertumbuhan bakteri, fungi, yeast dan juga mycoplasma. Berikut ini adalah beberapa jenis antibiotik yang umum digunakan beserta referensi mengenai mekanisme, kisaran penggunaan dan konsentrasi kerja yang diperlukannya.

*Singkatan: Gm(+/-)=Gram positif/negatif; My=mycoplasma; F=fungus; Ye=yeast.

Ampicillin

  • Kelas: Beta-lactam
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Menghambat transpeptidase yang diperlukan untuk sintesis dinding sel
  • Resistensi disebabkan oleh Beta-lactamase. Memotong cincin beta-lactam pada amphicillin
  • Konsentrasi: 100 – 200 ug/ml

Amphotericin B

  • Kelas: Beta-lactam
  • Kisaran: Ye, Fu, My
  • Mekanisme: Membentuk Kompleks dengan kolesterol, membentuk suatu pori yang membuat glukosa bisa lolos (leakage)
  • Konsentrasi: 2.5 ug/ml

Carbenicillin

  • Kelas: Beta-lactam
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Seperti ampicillin
  • Penyebab resistensi sama seperti ampicillin, tetapi carbenicillin rusak lebih lambat oleh beta-lactamase
  • Konsentrasi: 100 ug/ml

Chloramphenicol

  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Mengikat pada ribosomal 50S subunit, mencegah peptidyl transferase yang diperlukan untuk translasi
  • Resistensi disebabkan oleh Chloramphenicol acetyltransferase yang menambahkan sebuah gugus asetil untuk membentuk AcoA pada chloramphenicol, dengan menginaktifasinya
  • Konsentrasi: 5 – 10 ug/ml

Erythromycin

  • Kelas: Macrolide
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme mirip dengan chloramphenicol
  • Resistensi disebabkan oleh ermC methyltransferase yang memetilasi 23S rRNA, mencegah penempelan erythromycin ke ribosom
  • Konsentrasi: 100 ug/ml

Kanamycin

  • Kelas: Aminoglycoside
  • Kisaran: Gm+, Gm-, My
  • Mekanisme: Terikat pada 30S ribosomal sub-unit, memblokir inisiasi kompleks dan menyebabkan frame-shift mutations serta menghambat translasi
  • Resistensi disebabkan oleh Kanamycin phosphotransferase yang mempengaruhi posforilasi ATP-dependent pada residu-residu hydroxyl pada kanamycin
  • Konsentrasi: 100 ug/ml

Gentamycin

  • Kelas: Aminoglycoside
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Mirip dengan kanamycin
  • Resistensi disebabkan oleh Gentamycin acetyltransferase; mekanisme mirip dengan chloramphenicol acetyltransferase
  • Konsentrasi: 25 – 50 ug/ml

Neomycin

  • Kelas: Aminoglycoside
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Mirip dengan kanamycin
  • Resistensi disebabkan oleh Neomycin phosphotransferase; mekanisme mirip dengan kanamycin phosphotransferase
  • Konsentrasi: 25 – 50 ug/ml

Nystatin

  • Kisaran: Ye, Fu
  • Mekanisme: Mirip dengan amphotericin B
  • Konsentrasi: 50 ug/ml

Rifampicin (Rifampin)

  • Kelas: Semi-synthetic
  • Kisaran Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Menghambat DNA dependent RNA polymerase, mencegah terjadinya transkripsi
  • Konsentrasi: 50 ug/ml

Streptomycin

  • Kelas: Aminoglycoside
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Mengikat pada 16S ribosomal sub-unit, mencegah inisiasi pada translas
  • Resistensi disebabkan oleh Streptomycin 3’-adenyltransferase yang mentransfer gugus adenyl dari ATP ke streptomycin
  • Konsentrasi: 50 ug/ml

Tetracycline

  • Kelas: Tetracyclin
  • Kisaran: Gm+, Gm-
  • Mekanisme: Mencegah aminoacyl tRNA agar tidak terikat pada 30S sub-unit
  • Resistensi disebabkan oleh TetR-TN10 gene yang mengkodekan sebuah inner membrane protein yang memompa tetracycline keluar dari sel
  • Konsentrasi: 50 ug/ml

Sumber: bitesizebio.com

, ,

5 Responses to Antibiotik yang Digunakan dalam Biologi Molekular

  1. Eka May 29, 2009 at 2:53 pm #

    Hai, baru ini hari sempet berkunjung. Conggrats ya buat kerja kalian. Good. Yepy, tambahin dikit dong buat golongan sulphonamide dan fluoroquinolone. Thanks. Koreksi dikit, keterangan untuk yeast, di daftar singkatan tertulis Y tapi di dalam artikel Ye.

    • yepyhardi May 29, 2009 at 10:27 pm #

      Oke mbak Eka, thanks atas kunjungan, usulan dan koreksinya juga. Sering-sering mampir ye… khan udah pake Flash, hehe… ditunggu juga kiriman artikelnya :-)

  2. a. latifah June 15, 2009 at 9:33 pm #

    saya sdh sempat baca2 artikelnya tp kyknya ga bs ngasih artikel nih. maap ya. sukses ya! :lol:

  3. Tiurma Smjtk June 26, 2009 at 1:43 pm #

    artkelnya bagus-bagus jadi keingat lab lagi euy..ada dikit tambahan itu antibiotik yang digunakan tergantung persediaan di lab nya..:) umumnya doeloe digunakan ampicilin dan tetracyclin kons 100 Ug/UL

    • yepyhardi July 3, 2009 at 4:01 pm #

      wah… nostalgia ya? :-)
      ya, memang beberapa antibiotik bisa digunakan dengan kisaran konsentrasi tertentu…
      Makasih comment-nya..

Leave a Reply