Comments on: Sequence Alignment di BioEdit

By: yepyhardi

yepyhardi — Thu, 07 Jul 2011 11:24:11 +0000

Wass.wr.wb.
Wah senang sekali ada pembaca dari negeri jiran, mudah2an bisa bermanfaat utk kawan2 di sana.
Alamat email Akan saya sampaikan melalui email Bapak.
Silakan juga bergabung dengan Facebook page dan twitter kami agar selalu update. Betul…betul…betul?

By: Toto

Toto — Wed, 06 Jul 2011 15:07:03 +0000

Mas Yepy yang terhormat, salam kenal. Saya sekarang berada di Fakulti Sains Gunaan Universiti Institut Teknologi Mara Malaysia. Saya sedang ambil PhD. Saya berterimakasih sekali adanya web ini. Bolehkah saya berkenalan lebih dalam lagi. Saya merasa cocok dengan artikel yang Mas Yepi buat. Research saya sebenarnya mengarah ke enzime. Tapi dengan web ini boleh menolong. Boleh saya minta email mas Yepi. Ok wass, Maturnuwun.

By: yepyhardi

yepyhardi — Sun, 12 Jun 2011 07:07:08 +0000

Halo kiki, penyebabnya bisa macam2.
- kapiler yg digunakan terlalu pendek jd cm bisa baca sampai 270an bp saja.
- coba dilihat electropherogramnya, kl peaknya tinggi/bagus trus stlh itu jadi garis lurus, berarti memang dna yg disekuen panjangnya cuma segitu (plus kira2 50 bp pertama yg tdk bisa dibaca oleh alat). Tp kalo sampai ujung peak msh tinggi dan sepertinya msh ada peak lanjutan, kemungkinan pertama tadi penyebabnya.
- coba cek lg panjang produk yg disekuen dgn elektroforesis gel utk meyakinkan. Apakah ada unspecific band pd panjang 270+/-50 bp. Bisa jadi itu yg tersekuen.

Buka juga http://sciencebiotech.net/topics/biotechnique/dna-sequencing/

Semoga bisa membantu..

By: kiki

kiki — Thu, 19 May 2011 04:36:31 +0000

assalamu’alaikum
mas yepy
saya mau nanya
tp ga terkait postingan ini
gpp ya

jadi riset saya
hasil sekuensingnya tidak full
seharusnya sampe 580 pb
tapi hasilnya cuma sampe 270 pb
itu kenapa yah?
mohon penjelasannya yah

trims

By: yepyhardi

yepyhardi — Thu, 05 May 2011 09:20:33 +0000

Wa’alaikumussalam wr.wb.
Halo Rike, thanks buat comment-nya… Kita seneng kalo tulisan2 kita bisa membantu… Kalo ada yg masih bingung bisa tanya via comment ini, via Facebook Page Sciencebiotech.net atau via email…

By: Rike

Rike — Thu, 21 Apr 2011 11:37:25 +0000

Assalamu’alaykum

Sangat suka semua artikel yang ada di web ini. Banyak pertanyaan yg terjawab setelah buka web ini. Kebetulan penelitian skripsi saya juga tentang ini. Terimakasih mas yepy..

Kalau ada yang bingung, boleh ya mas tanya2..^^

By: Membuat Pohon Filogenetik

Membuat Pohon Filogenetik — Tue, 22 Feb 2011 07:28:39 +0000

[...] dalam satu file. Hal ini bisa dilakukan dengan bantuan software seperti BioEdit (lihat artikel Sequence Alignment di BioEdit), sekuen-sekuen tersebut disimpan dalam satu file berformat FASTA agar lebih mudah [...]

By: yepyhardi

yepyhardi — Mon, 15 Nov 2010 16:03:07 +0000

Dear pak Riza,
Sorry for late reply. Please find our article focusing on Phylogenetic tree here (http://sciencebiotech.net/membuat-pohon-filogenetik/)

By: Riza

Riza — Sat, 23 Oct 2010 03:52:33 +0000

Mas Yeppi, thanks for your help to me about sequen my isolate last month ago, and now i will try to make of phylogenetic tree design. My be i found difficulty in make this design, i hope you can help me again. Thank’s

By: Ayi

Ayi — Thu, 23 Sep 2010 07:04:07 +0000

Dear Mas Yepi,

selintas melihat artikel tentang BioEdit ini sudah menjadi makanan Saya sehari2 karena Saya bekerja sebagai bioinformatics officer di sebuah oil palm plantation. Beberapa software dan programing language Saya harus handle. Tidak hanya software saja, pada saat Saya pertama menjadi seorang bioinformatician, tantangan terbesar yang harus Saya hadapi adalah pada handling high throughput genotyping data sehingga dapat dilakukan analisa selanjutnya seperti genetic diversity.

Bioinformatika memang ilmu yang relatif baru di Indonesia, Saya melihat belum ada universitas yang mempunyai jurusan ini, akan tetapi jika program studi atau minor beberapa sudah ada.

Saya tunggu jika ada informasi pelatihan bioinformatika, terutama yang lebih cenderung ke computational Biology karena basic IT Saya kurang.