Archive for: primer design

Menguji Spesifisitas Primer

PCR, sangat bergantung pada spesifitas primer (image from daysinutm.blogspot.com)

PCR, sangat bergantung pada spesifitas primer (image from daysinutm.blogspot.com)

Pada artikel sebelumnya dengan judul “Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus” telah dijelaskan langkah-langkah desain primer. Di sana dicontohkan bagaimana cara mendesain primer untuk mendeteksi keberadaan virus TMV (Tobacco Mozaic Virus) yang biasa menyerang tanaman tembakau dan jenis-jenis tanaman golongan Solanaceae.

Primer yang telah kita desain tersebut harus diuji spesifisitasnya agar kita yakin bahwa:

+Continue Reading

Istilah pencarian terpopuler untuk artikel ini:
spesifitas adalah (20) | spesifisitas primer (10) | deteksi tmv dengan pcr (6) | spesifisitas (6) | tobacco mosaic virus primer (6) | langkah uji pcr (4) | tabel mikroba dan perannya (4) | langkah isolasi gen dengan disain primer (4) | tabel polymerase chain reaction (3) | pohon filogenetik pada tumbuhan (2) | specifitas (2) | yeppy uji spesifitas primer (2) | jenis-jenis primer pada pcr (2) | tabel pcr (2) | contoh email blast (2) | cara membuat DNA Primer (2) | uji spesifisitas primer (2) | RT PCR dan spesifitas primer (2) | tabel hasil bioteknologi (1) | uji spesifisitas (1) |

Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus

Molekul DNA

Molekul DNA

PCR alias Polymerase Chain Reaction adalah salah satu teknik yang paling banyak digunakan dalam biologi molekuler. Dengan PCR, DNA dalam jumlah yang sangat sedikit dapat kita lipatgandakan untuk selanjutya diidentifikasi, dimanipulasi dan bisa pula digunakan untuk keperluan forensik, diagnosis virus penyakit dan sebagainya.
Selain enzim Taq DNA Polymerase yang menjadi kunci pokok teknik PCR, ada satu komponen lagi yang tak kalah pentingnya, yaitu Primer PCR. Spesifisitas dan efisiensi PCR amat ditentukan oleh kualitas primer yang digunakan. Sekarang yuk kita bahas bagaimana caranya mendesain primer untuk PCR.
+Continue Reading

Istilah pencarian terpopuler untuk artikel ini:
cara desain primer (15) | mendesain primer (13) | animasi PCR (9) | molekul dna (9) | cara membuat primer PCR (9) | cara desain primer? (8) | diagnostik molekuler (8) | primer3plus (7) | • yuk mendesain primer dengan primer3plus (6) | membuat primer (6) | bagaimana mengetahui primer kita dapat mengamplifikasi rna (6) | cara merancang primer (5) | tehnik pembuatan primer dna (5) | mirna widiyanti (4) | polymerase chain reaction berfungsi untuk (4) | membuat primer DNA (4) | contoh Desain primer untuk PCR (4) | nama primer genetika definisi (4) | logo diagnostik molekuler (4) | jasa desain primer pcr (3) |

Parameter Penting dalam Desain Primer

Struktur sekunder RNA, bisa juga terjadi pada oligonucleotida atau primer (image from poniecki.org)

Struktur sekunder RNA, bisa juga terjadi pada oligonucleotida atau primer (image from poniecki.org)

Bila pada artikel “Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus” dan “Desain Primer Menggunakan PerlPrimer” sudah dijelaskan tahapan dalam mendesain primer untuk PCR, maka dalam artikel ini kita akan mempelajari parameter apa saja yang harus kita perhatikan agar kualitas primer yang kita desain benar-benar terjamin. Beberapa hal berikut ini dapat kita jadikan bahan pertimbangan ketika mendesain primer. +Continue Reading

Istilah pencarian terpopuler untuk artikel ini:
struktur RNA (33) | desain primer untuk pcr (21) | parameter primer (6) | parameter penting dalam desain primer (6) | menentukan suhu lebur (4) | penentuan suhu lebur (4) | suhu annealing PCR penting (4) | menghitung panjang produk pcr (4) | struktury rna (3) | suhu yang terlalu tinggi pada pcr akan menyebabkan (3) | struktur hairpin pada dna (2) | penentuan suhu anealing (2) | produk suhu (2) | homologi (2) | panjang produk pcr (2) | pcr primer membentuk hairpins (2) | energi bebas gibbs adalah (2) | apa yang dimaksud dengan temperature melting dalam pcr (2) | TM dari susunan primer gen (2) | suhu annealing pada pcr (2) |
x