Home » BioBasics You are browsing entries filed in “BioBasics”

Quorum Sensing (A Video Animation)

Video di atas adalah hasil karya Andrew Dopheide, yang menggambarkan proses signaling dan quorum sensing. Bakteri yang berdiri sendiri tidak dapat membentuk biofilm, ia harus menunggu sampai sekelompok bakteri dengan jumlah tertentu telah terkumpul. Lalu, bagaimana caranya bakteri tersebut mengetahui bahwa jumlah mereka sudah cukup? (Padahal mereka kan gak punya jari untuk menghitung ) Ternyata [...]

August 3 2010 | Posted in BioBasics, BioMicro, Biotechnology, Video | Read More »

Replikasi DNA

Replikasi DNA

Replikasi DNA terlihat sulit pada awalnya. Namun ketika anda sedikit berusaha mempelajarinya ternyata sangat simple dan mudah untuk di mengerti. Agar lebih mudah dalam memahami artikel ini, sangat disarankan agar lebih dulu membaca Mengenal DNA Lebih Dekat (anatomi DNA). Proses replikasi pertama kali di mulai ketika enzyme Helicase memutus ikatan kimia yang paling lemah diantara [...]

May 8 2010 | Posted in BioBasics, BioChemistry, Biotechnology | Read More »

Menguji Spesifisitas Primer

Menguji Spesifisitas Primer

Pada artikel sebelumnya dengan judul “Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus” telah dijelaskan langkah-langkah desain primer. Di sana dicontohkan bagaimana cara mendesain primer untuk mendeteksi keberadaan virus TMV (Tobacco Mozaic Virus) yang biasa menyerang tanaman tembakau dan jenis-jenis tanaman golongan Solanaceae. Primer yang telah kita desain tersebut harus diuji spesifisitasnya agar kita yakin bahwa: Primer tersebut [...]

April 25 2010 | Posted in BioBasics, BioInformatics, Biotechnology | Read More »

Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus

Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus

PCR alias Polymerase Chain Reaction adalah salah satu teknik yang paling banyak digunakan dalam biologi molekuler. Dengan PCR, DNA dalam jumlah yang sangat sedikit dapat kita lipatgandakan untuk selanjutya diidentifikasi, dimanipulasi dan bisa pula digunakan untuk keperluan forensik, diagnosis virus penyakit dan sebagainya. Selain enzim Taq DNA Polymerase yang menjadi kunci pokok teknik PCR, ada [...]

April 19 2010 | Posted in BioBasics, BioInformatics, Biotechnology | Read More »

Parameter Penting dalam Desain Primer

Parameter Penting dalam Desain Primer

Bila pada artikel “Yuk Mendesain Primer dengan Primer3Plus” dan “Desain Primer Menggunakan PerlPrimer” sudah dijelaskan tahapan dalam mendesain primer untuk PCR, maka dalam artikel ini kita akan mempelajari parameter apa saja yang harus kita perhatikan agar kualitas primer yang kita desain benar-benar terjamin. Beberapa hal berikut ini dapat kita jadikan bahan pertimbangan ketika mendesain primer. [...]

April 19 2010 | Posted in BioBasics, BioInformatics, Biotechnology | Read More »

GenBank; Bank Data Genetik Online Gratis

GenBank; Bank Data Genetik Online Gratis

Siapapun yang berkecimpung dalam dunia genetik pasti mengenal dan pernah berurusan dengan GenBank, bahkan tak berlebihan jika GenBank disebut sebagai referensi utama mereka. Sebenarnya bank macam apakah GenBank itu? Bank ini adalah database sekuen genetik, semua sekuen DNA teranotasi dan tranlasinya yang dipublikasikan di seluruh dunia ada di sini. Data pada GenBank selalu bertambah setiap [...]

April 13 2010 | Posted in BioBasics, BioInformatics, Biotechnology | Read More »

Berkenalan dengan Virus

Berkenalan dengan Virus

Makhluk yang satu ini sudah tidak asing lagi bagi manusia, ia sering diidentikkan dengan penyakit karena umumnya kita mengenal virus sebagai salah satu agen penyebab penyakit. Tentu kita belum lupa kehebohan penyakit flu burung dan flu babi yang membuat kita bergidik ngeri. Bagaimana tidak? makhluk tak kasat mata itu bisa membuat manusia tiba-tiba tak berdaya, [...]

March 24 2010 | Posted in BioBasics, Biotechnology | Read More »

Mengenal Teknik DNA Sequencing

Mengenal Teknik DNA Sequencing

Bagaimana prinsip analisa DNA Sequencing berbasis Sanger Method yang fenomenal dan kini menjadi andalah jutaan ilmuwan di seluruh dunia? Informasi genetik pada suatu makhluk hidup tersimpan pada DNA-nya. Nah, untuk mengetahui informasi genetik tersebut digunakan teknik DNA Sequencing, yaitu metode yang digunakan untuk menentukan urutan basa nukleotida (adenine, guanine, cytosine dan thymine) pada molekul DNA. [...]

August 29 2009 | Posted in BioBasics, Biotechnology, DNA Sequencing | Read More »

Regulasi dan Ekspresi Genetik

Regulasi dan Ekspresi Genetik

Bagaimana sebuah sel tunggal “zygote” hasil pembuahan bisa tumbuh menjadi seorang manusia utuh dengan seratusan triliun sel kompleks yang berbeda-beda bentuk, ukuran dan variasi-variasinya? Dan bagaimana pula caranya setiap sel tumbuh pada tempatnya tanpa tertukar satu sama lain? Kita tahu bahwa setiap sel memiliki satu paket utuh DNA yang merupakan resep genetik, pada manusia paket [...]

August 22 2009 | Posted in BioBasics, Biotechnology | Read More »

Kode Genetik, Resep bagi Kehidupan

Kode Genetik, Resep bagi Kehidupan

Mengungkap bagaimana DNA dibaca sebagai resep untuk membuat protein. Karena fungsinya ini, DNA dinobatkan sebagai buku resep atau cetak biru (blueprint ) bagi kehidupan. Bila bilangan biner yang hanya terdiri dari angka 0 dan 1 saja bisa membuat komputer melakukan berbagai pekerjaan, maka DNA tentunya bisa berbuat lebih hebat lagi. Sebab DNA terdiri dari 4 [...]

July 10 2009 | Posted in BioBasics, Biotechnology | Read More »