Archive for the ‘Biotechnology’ Category

Fun Facts about Genetics

Image from http://www.genetic-programming.org

Ilmu genetika dan biologi memiliki berbagai fakta yang unik dan menarik. Dalam artikel kali ini akan coba diangkat beberapa fakta menarik seputar kedua ilmu tersebut. What are they? Let’s check it out!
+Continue Reading

Review: Faktor-faktor yang Mempengaruhi Ekspresi Protein Heterologus di dalam E. coli

E. coli diamati menggunakan mikroskop elektron (image from Wikipedia)

E. coli diamati menggunakan mikroskop elektron (image from Wikipedia)

Di antara berbagai mikroorganisme yang dapat digunakan untuk memproduksi protein heterologus, E. coli menjadi salah satu pilihan yang paling menarik. Berbagai keunggulan yang dimiliki E. coli antara lain adalah kemampuannya untuk tumbuh dengan cepat, densitas sel yang tinggi, substrat pertumbuhan yang murah, karakteristik genetik yang jelas, serta ketersediaan berbagai pasangan vektor kloning dan strain mutan. Meskipun tidak selalu ada jaminan bahwa protein heterologus akan dihasilkan oleh E. coli dalam jumlah yang tinggi dan aktif secara biologis, berbagai cara telah dilakukan untuk meningkatkan performa dari mikroorganisme ini. Berikut ini adalah sedikit penjelasan mengenai faktor-faktor yang selama ini dikaji berbagai peneliti untuk meningkatkan performa E. coli sebagai inang ekspresi protein heterologus: +Continue Reading

Troubleshooting pada SDS-PAGE (Bagian 3 – Habis)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Sampai saat ini kita telah melihat masalah yang timbul selama proses persiapan dan running SDS-PAGE. Kali ini kita akan melihat dan membagikan solusi atas masalah yang biasa muncul saat proses sesudah running terutama saat proses pewarnaan hasil elektroforesis.

+Continue Reading

Troubleshooting pada SDS-PAGE (Bagian 2)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Memang banyak sekali faktor yang bisa mempengaruhi keberhasilan SDS-PAGE. Pada artikel bagian pertama kita sudah membahas beberapa masalah yang sering terjadi dan pemecahannya. Sekarang kita akan melanjutkan pembahasan beberapa masalah yang biasa muncul saat menjalankan SDS-PAGE dan solusi mengatasinya.
+Continue Reading

GFP dalam Studi Ekspresi Gen

GFP diisolasi dari Ubur-ubur untuk digunakan dalam studi ekspresi gen (image from nobelprize.org)

GFP diisolasi dari Ubur-ubur untuk digunakan dalam studi ekspresi gen (image from nobelprize.org)

GFP atau Green Fluorescent Protein adalah protein yang dapat berpendar yang secara alami dihasilkan oleh ubur-ubur. GFP kini digunakan secara luas dalam studi-studi ekspresi gen maupun mikroskopik karena aplikasinya yang relatif mudah. Hanya dengan adanya pendaran cahaya dapat menunjukkan bahwa gen yang kita teliti terekspresi. Hmm, bagaimana bisa?
+Continue Reading

Proses Perbaikan DNA yang Rusak: Mencari Jarum dalam Tumpukan Jerami

Mekanisme Reparasi DNA (Credit: Image courtesy Cees Dekker lab TU Delft / Tremani)

Mekanisme Reparasi DNA (Credit: Image courtesy Cees Dekker lab TU Delft / Tremani)

Kerusakan DNA bisa saja terjadi secara tiba-tiba. Penyebabnya juga bermacam-macam, bisa berupa radiasi UV, bahan kimia mutagen, ataupun oksidasi; dan salah satu bentuk kerusakan DNA adalah terpotongnya kedua utas DNA. Hal ini bisa menjadi masalah yang serius karena sel tidak bisa menggunakan DNA yang terpotong-potong seperti itu untuk beraktivitas secara normal. Jika dibiarkan saja, maka hal ini juga bisa menjadi penyebab timbulnya kanker. Namun demikian, kita tidak perlu kuatir karena sebenarnya sel-sel kita sendiri mempunyai suatu sistem reparasi yang luar biasa canggih, efisien, dan nyaris tidak pernah salah. Nah, pertanyaannya adalah bagaimana cara kerjanya? +Continue Reading

Troubleshooting pada SDS-PAGE (Bagian 1)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Perangkat PAGE Vertikal (image from uniequip.com)

Sebelumnya telah diberikan beberapa tips dan trik yang dapat mempermudah pengerjaan SDS-PAGE namun tentunya masalah bisa datang tanpa ada yang tahu. Apakah hasil yang buruk, proses SDS-PAGE yang terganggu, atau kerusakan di gel, banyak sekali hal yang dapat memperlambat dan mengganggu proses pengumpulan data kita. Dalam artikel kali ini akan dibahas troubleshooting untuk beberapa masalah yang umum ditemukan pada proses SDS-PAGE. Semoga dapat membantu!

+Continue Reading

Makhluk Purba Nan Panjang Umur

Bakteri purba dari sedimen sub-permukaan (image from: the-scientist.com)

Bakteri purba dari sedimen sub-permukaan (image from: the-scientist.com)

Kalau kita menganggap bahwa satu-satunya makhluk purba zaman dinosaurus yang masih bertahan hingga saat ini adalah komodo si reptil raksasa, ternyata tidak. Begitu pula kalau kita menganggap bahwa zaman ini sudah tidak ada makhluk yang bisa hidup ribuan tahun, ternyata masih ada. Ya, dialah si bakteri purba yang berasal dari masa sekitar 86 juta tahun lalu atau di saat T-Rex dan kawan-kawannya masih berkeliaran. Mereka terkubur di kedalaman 20 meter dari dasar lautan pasifik bagian utara, dan ajaibnya hingga saat ini masih hidup! Bagaimana bisa?

+Continue Reading

Pembangkit Listrik Tenaga Virus

Listrik dapat dihasilkan dari virus (image from engadget.com)


Jika selama ini kita mengenal virus sebagai makhluk yang menjadi sebab penyakit dan menyedot energi dari tubuh yang diserangnya, ternyata kini ia dapat digunakan untuk membuat suatu pembangkit listrik kecil bertenaga virus. Memang ini bukan pembangkit listrik besar setara PLTA, tetapi dengan adanya temuan para ilmuwan di Laboratorium Nasional Lawrence Berkeley Departemen Energi AS ini akan memungkinkan kita mengisi kembali baterai handphone atau ipod kita sambil berjalan kaki tanpa pusing nyari-nyari colokan listrik.

+Continue Reading

Tips & Trik untuk SDS PAGE

SDS PAGE

SDS PAGE

Tidak seperti elektroforesis agarose yang persiapannya cukup sederhana, banyak peneliti menemukan masalah saat akan melakukan persiapan SDS-PAGE (Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis). Bahan yang berbahaya, proses pembuatan yang memakan waktu, sampai berbagai macam resiko seperti kebocoran dan gel yang tidak membeku menyebabkan SDS-PAGE sering dikatakan ‘merepotkan’. Beberapa cukup beruntung dapat menggunakan gel pre-set namun masih banyak dari kita yang harus menyiapkan dari nol. Di website ini telah dibahas cara mencegah kebocoran SDS-PAGE dan kali ini akan dipaparkan tips dan trik dalam menjalankan SDS-PAGE untuk meminimalisir kesalahan dan meningkatkan kualitas hasil yang didapat. +Continue Reading

x